Türkiye'ye dönüşünde, Akıl ve Ruh Hastalıkları hastanesinde klinik şefi oldu. Üniversite reformunda Tıp fakültesine doçent olarak girdi (1933). 1945' de profesörlüğe, 1951' de ordinaryüs profesörlüğe yükseldi.
Psikiyatri kürsüsü başkanlığından emekliye ayrılan (1973) İhsan Şükrü Aksel, 1987' de İstanbul'da vefat etti.
Eserleri : "Nörotrop virüslü ansefalitler (1944)", "Genel Psikiyatri (1946)", "Psikozların Anatomisi (1947)".
