VÜCUDUN bağışıklık sisteminin, kendi dokularına yönelik olarak yıkıcı bağışıklık cevabı geliştirmesiyle ortaya çıkan duruma "otoimmünite" denilir.
Normalde, vücudun bağışıklık sistemi, kendi dokularına karşı immünolojik tolerans gösterir. Bağışıklık sistemi hücreleri, vücudu oluşturan yapıları "kendine ait" olarak tanıdığı için bu yapılara karşı hiçbir tepki göstermez. Bu yüzden vücudun kendi dokularını, bağışıklık tepkimesiyle reddetmesi mümkün olmaz.
Bebekte doğumdan önce ve sonra, bazı doku bileşenlerine karşı kâfi tolerans gelişmez (meselâ göz merceğini oluşturan proteinlere karşı). Böylece, bağışıklık sistemi hücrelerinin bu bileşenlerle karşılaşması neticesinde otoimmünite tepkisi ortaya çıkar.
Çeşitli sebeplerle gelişen doku hasarı da otoimmünite tepkisine yol açabilir. Çünkü doku hasarı neticesinde açığa çıkan maddeler, bağışıklık sistemi hücrelerince tanınmaz. Bazen bağışıklık tepkisi, organizmanın kendi yapılarını hedefler. Otoimmünite birçok hastalığın temelinde yatabilir.
