Günah duygusunun verdiği bir iç daralmasıyla ağır bir manevî buhran geçirdikten sonra baptist'ler mezhebine girdi (1653) ve bu yolda en iyi konuşan vâizlerden biri oldu.
2. Charles'ın tekrar tahta çıkışından (1660) az sonra, vaazlarının kışkırtıcı olduğuna hükmedildi ve 1672' ye kadar Bedford'da hapsedildi. Sonraları vaazlarına devam etti.
Hayatının sonları çok dolu bir yazarlık ve din yayma faaliyetiyle geçti. Mistik ve coşkulu bir hayâl gücüyle yazdığı ilk eser, dinî inançlarındaki değişimi anlattığı "Büyük Günahkâra Yağan Tanrı Rahmeti (1666)" adlı kitabıdır.
En tanınmış eseri, ilk bölümünü tutuklu olduğu sırada yazdığı ve 2. bölümünü de 6 sene sonra tamamladığı (1684) "Hacının Seyahati" dir. Külliyatı 60 ciltdir.
Üstün değerdeki 2 dinî ve alegorik eseri; "Mr. Badman'in Hayatı ve Ölümü (1680)" ve "Kutsal Savaş (1682)"dır. John Bunyan, 1688' de Londra'da vefat etti.
